目前，世界上有机肥积造与利用最早的历史遗迹可以追溯到年前的苏美尔文明。我国早在秦汉之前，也有用有机肥养地的实践，历代有关农书详细记述了有机肥的种类、作用、积造与施用方法。到了清代，我国有机肥有10大类多种。年农业部开展全国有机肥料调查研究，分为10大类个品种。
我国自古代直至20世纪70年代，农业生产上所用的肥料主要靠有机肥料，基本保持了水稻和小麦单位面积产量的稳定，并有缓慢的增加。20世纪中期，因为化肥的推广应用，有机肥的地位日益下降。我国年有机肥施用占肥料施用总量的比例为99.9%，年为91.0%，年为80.7%，年为66.4%，年降为47.1%，年为43.7%，年为36.7%，年为31.4%，年为25%。
由于化肥的大量使用，农业生产发生了巨大的变化，在带来巨大经济效益和满足人口急剧增长需求的同时,其负面影响也日臻显露,如土壤地力下降、环境质量恶化、食品质量安全事故时有发生等。因此，人们对有机肥又逐渐重视起来。
但是有机肥的不合理使用也会在土壤质量、环境质量以及食品安全方面造成负面影响，如不引起足够重视，其副作用甚至超过化肥。土壤质量是指土壤维持作物生产能力、保持环境质量及促进动植物健康的能力。因此，有机肥的使用将从正反两个方面强烈影响土壤质量。
在现代农业生产中，有机肥料的施用不仅直接关系到土壤质量、农作物的产量和品质、水体和大气环境质量，而且它还是种植业与养殖业之间的重要纽带，对促进农田生态系统和生物圈中的物质循环与能量转化也有重要作用。有机肥种类繁杂，性质各异，为了充分发挥有机肥的正向作用而尽量减少其负面影响，我们必须对各种有机肥的特性、在土壤中的转化过程及其对土壤、环境质量和农作物的影响有较清晰的了解，从而制订科学的施用规范。
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有机肥对土壤肥力质量的影响
1.1提高土壤肥力
多年来，有机肥对维护地力起了巨大作用。20世纪初，美国中西部农田土壤发生明显退化，为寻找对策，年美国著名土壤学家King对中国、朝鲜、日本的农业进行了考察，并于年出版了《四千年的农民：中国、朝鲜和日本的恒久农业》一书，总结了有机肥（包括绿肥）在维持土壤质量和农田生产力方面的重要作用。
世界上最早开展有机肥科学实验研究的是英国人鲁茨（JohnBennetLawes）。早在年他便采用盆栽试验研究了有机肥对土壤和作物产量的影响，随后又开展了田间试验的探索。其研究结果直接催生了他年利用骨粉和硫酸生产磷肥，并与吉尔贝特（JosephHenryGilbert）一起于年建立了著名的英国洛桑试验站（RothamstedExperimentalStation）。该站迄今已多年，长期定位研究有机肥与化肥连续施用对土壤和作物产量的影响。年开始的Hoosfield长期定位试验结果表明，连续每年施用35t/hm2的厩肥，土壤氮含量增加1倍以上。
大量长期实验结果表明，有机肥施用可增加土壤有机质，进而显著增加土壤的矿化氮，作物产量增加明显。但很多长期试验结果也表明，有机肥和化肥对作物均有极好的增产效果和持续的增产作用，二者间产量无显著差异，而化肥和厩肥配合无论是近期或者长期都可取得较高的产量和经济效益。
我国科学家对各种有机肥料及肥效开展了大量研究。早在20世纪30—40年代，陈尚谨等人便在华北开展了有机肥的调查与试验；陈恩凤、彭家元等在四川开展了有机肥施肥技术研究；*瑞采、裴保义等用复因子设计，对人粪尿、堆肥和绿肥进行了长达9年的稻田施肥试验。20世纪50年代以来，我国有关单位与科学家对各种有机肥在不同土壤与作物上开展了大量研究，尤其是80代建立了全国性的肥料长期定位试验网，包括中科院的CERN、中国农科院的全国肥料试验网等。
如中国农科院土壤肥料所从年开始，在全国个定位试验点上进行了5年以上的有机肥肥效试验研究，结果表明，有机肥增产效果有逐年增加的趋势，且有明显的残效。我国多个5年以上的定位试验研究表明，施用有机肥与不施有机肥比较，平均增产率为12.8%。
国内外大量研究结果表明，合理施用有机肥料不仅可以增加土壤有机碳含量，改善土壤物理结构，增加土壤CEC、保水能力、渗透性，提高土壤N、P、K、Ca、Mg、S及其他微量元素含量，促进土壤微生物活动，改善土壤微生物群落结构，提高土壤肥力，改善农产品品质。
有机肥和无机肥料配合施用效果更佳，还可以提高化学肥料的利用率。吨粮田能够连续17年（—年）维持养分平衡，其关键在于有机肥和化肥配合施用，并在化肥中再进行N、P、K适当配比。
—年，经粮、油、果、菜、烟、茶等20多种作物30多项有关品质指标的分析研究表明，有机肥与化肥养分平衡配合施用均不同程度提高了所有供试作物的产品品质。
1.2抑制作物病害
有机肥施用可抑制作物病害。20世纪70年代，国外便开始研究有机肥与植物病害的关系，随后开发出各种抑制土传病害的生物有机肥。从20世纪90年代开始，我国一些科研单位和企业相继研制和生产一类被统称为“生物有机肥”的产品并投放市场。年全国共有商品有机肥企业家，其中生物有机肥企业家，占总数的8.94%，生物有机肥产量万吨，占生物有机肥企业生产能力的83.6%。
具有抗病特性的生物有机肥的作用机理可能包括物理、化学、生物的作用。一方面有机肥可改善土壤物理结构，并平衡提供作物所需养分以及一些生物活性物质，植物生长健壮而抗病能力增强，同时有机肥含有拮抗菌或促生菌，改变根际微生物区系，进而抑制病原菌的爆发。因有机肥、土壤、病害类型复杂多变，迄今生物有机肥的作用机理尚未完全清楚，其在生产中的应用效果也不稳定，难以有效地、定向地施用生物有机肥而达到预期的防病效果。
1.3引起土壤质量退化
传统的观念认为有机肥对土壤质量均是正向作用，有机肥可减缓土壤板结、阻止土壤次生盐渍化，但有机肥的不合理施用也会造成土壤质量退化。《陈旉农书·粪田之宜篇》第一次记载了我国古代农民“用粪犹用药”的施肥理念，提出有机肥须合理施用。
规模化养殖场的畜禽粪，尤其是鸡粪含有较高的盐分和Na离子，如果过量施用，则会有土壤次生盐渍化的风险，使土壤板结。根据Moral等人的研究结果，当畜禽粪施用量达到7—10t/（hm2a），农田土壤的Na+和Cl-负荷可达kg/hm2，可致西班牙东南部半干旱地区土壤产生显著的次生盐渍化风险。王辉等人的研究表明，在目前的有机肥施用状况下，畜禽粪便农用对露天土壤没有显著的土壤次生盐渍化风险，而对于温室大棚土壤而言，在高施肥量下次生盐渍化风险较大，可严重影响农作物的生长。
而目前蔬菜等经济作物上有机肥施用量普遍较高，例如山东寿光等地大棚蔬菜地土壤有机肥年施用量最高达t/hm2鲜粪，有机肥带来的土壤次生盐渍化风险不容忽视。
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有机肥对土壤环境和健康质量的影响
自20世纪90年代以来，因系列环境问题的日益凸显，国内外研究的
