“自从发布第一期华大基因宏基因组CNNS的盘点后,科技君后台收到了许多关于宏基因组的问题,也引发了大家热烈的讨论。遂加班加点赶制第二部分“特定人群Meta研究”的文章,希望大家继续支持我们。”
前期回顾:宏基因组CNNS文章盘点①——参考基因集一、肠型[1]Enterotypesofthehumangutmicrobiome(Nature,IF38.,)
图1.对不同来源的三份数据(a,b,c)进行PCA聚类分析,均得到以拟杆菌属、普氏菌属和瘤胃球菌属为肠道菌群代表的三个显著分离的群体(肠型)。
本研究选择22份欧洲人粪便样品进行测序,并和之前公布的数据进行整合分析,发现可通过三个菌属水平的变化进行肠型分类:拟杆菌属(肠型1)、普氏菌属(肠型2)、瘤胃球菌属(肠型3),这三种肠型与BMI,年龄,性别并没有明显的关联。物种只是肠道菌群分析的一个层面,而且高丰度物种并不直接和高丰度功能相关联;要充分理解肠道菌群结构,除了